游离多组学（Liquid Biopsy Multi-Omics）
从血浆cfDNA中整合基因组、甲基化组与片段组学特征，实现非侵入性癌症早筛、微小残留病灶监测与组织溯源。提供标准化特征提取到临床模型构建的全流程方案。
核心分析流程（4个标准化流程）
WF-CF001
中级基础特征提取与整合
2-4h
提供13类标准化多组学特征输出，支撑下游全部临床诊断与监测应用。
推荐工具：
查看流程cfDNAFEFinaleToolkitcfToolsTrim Align Pipeline
WF-CF002
中高多癌种早期检测/筛查
4-6h
基于多模态融合策略整合片段组学与甲基化组学，构建高灵敏度诊断模型，支持泛癌筛查与组织溯源。
推荐工具：
查看流程ELSMGutSeerclinic-RadmCSHAP
WF-CF003
高MRD监测
3-5h
支持Tumor-informed突变追踪与Tumor-naive甲基化双策略，动态追踪术后复发风险。
推荐工具：
查看流程MuTect2ichorCNAMobiCTTORNADOHcSeer
WF-CF004
中级组织溯源与去卷积
1-2h
基于甲基化数据推断cfDNA细胞/组织来源，辅助筛查阳性定位与原发灶判定。
推荐工具：
查看流程cfToolscfDeconBismarkcfDNAFE
流程间协同关系
WF-CF001为所有下游流程提供标准化特征输入；WF-CF004可作为独立模块运行，也可嵌入WF-CF002与WF-CF003增强组织溯源能力。
核心推荐工具
最新动态与计划
v
v1.0 正式发布
2026-04- WF-CF001 基础特征提取与整合
- WF-CF002 多癌种早期检测/筛查
- WF-CF003 MRD监测
- WF-CF004 组织溯源与去卷积
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计划更新 v1.1
预计 2026-07- WF-CF001 整合纳米孔长读长测序（FLARE）分析模块
- WF-CF002 增加微生物cfDNA（mcfDNA）检测模块，参考microeco包多组学标准化流程
- WF-CF003 整合多时间点纵向数据分析模块
- WF-CF004 增加单细胞甲基化去卷积支持