单细胞转录组（Single-Cell Transcriptomics）

单细胞转录组领域的通用基础设施。覆盖10× Genomics、SMART-seq、长读长等多平台定量，区分scRNA-seq与snRNA-seq质控标准，包含空液滴检测、环境RNA去污染与双细胞去除。

跨样本/跨平台数据整合的基础。覆盖传统方法（Harmony、CCA/RPCA）、深度生成模型（scVI系列）与大规模后端（Seurat v5 BPCells），支持千万级细胞整合。

利用大语言模型架构对单细胞数据进行预训练表征学习，实现零样本/少样本细胞类型注释、扰动预测与跨物种迁移分析。

基于标记基因、参考图谱映射与AI辅助的自动化细胞类型注释，覆盖从聚类到精细亚型分类的完整流程。

基于剪接/未剪接RNA动态推断细胞状态转换方向与速率，整合RNA速度、伪时间分析与命运概率预测。

基于配体-受体互作数据库推断细胞间通讯网络，识别关键信号通路与细胞微环境调控关系，支持空间转录组通讯分析。

将scRNA-seq参考数据与空间转录组数据整合，实现空间位置上的细胞类型反卷积、基因表达映射与组织微环境解析。

面向百万级细胞的大规模分析基础设施，包含Metacell聚合降噪、内存外计算后端、GPU加速与交互式可视化平台。